Διάδοχος του Ιωάννη Βατάτζη ήταν ο γιος του Θεόδωρος Β΄ Λάσκαρις. Αυτόςστο ζήτημα των εκκλησιαστικών ήθελε να καλέσει οικουμενική σύνοδο για να κρίνει εκεί ο ίδιος τις διαφωνίες. Το 1256 έστειλε στον πάπα Αλέξανδρο Δ΄ δύο ευγενείς και του ζήτησε να στείλει αντιπροσώπους του στη Νίκαια. Ο πάπας πρόθυμα δέχτηκε. Οι συζητήσεις θα είχαν ως βάση τις συμφωνίες του Βατάτζη. Και αυτή όμως η προσπάθεια απέτυχε γιατί ο πάπας ήθελε να είναι συντονιστής και μυστικά προεδρεύων αυτής της συνόδου ο αντιπρόσωπός του, πράγμα που ο αυτοκράτορας δεν δέχτηκε.
Ο Θεόδωρος Β΄ Λάσκαρις πέθανε το 1258.